Nature:全新致癌机制,比方说驱动异常染色质成环,促进癌症发展
2021-12-13 09:15 来源:昭通妇科医院
帕金森氏症的其发展与抗病毒胺基酸内在无序区域(IDR)的基因基因序列反常密切涉及。各种胺基酸(包括酪氨酸遗传器物质、肝细胞调节剂和RNA联结抗原)中都的IDR通过试管-试管比方说(LLPS)逐步形成孕育器物,因素从细胞器逐步形成和刺激耐受到基因基因序列酪氨酸的无数生器物更进一步。
便是的试管-试管比方说(LLPS)是指称联结两个不涉及基因基因序列凋亡的更进一步。该更进一步愈演愈烈在细胞器内,并能够逐步形成带有各种器物理特连续性的域,这些域可以有助于帕金森氏症,例如急连续性胃癌的愈演愈烈其发展。在急连续性胃癌中都,线粒体抗原(NUP98或NUP214)的反复染色微易位产生了一种反常联结微,它总是延续线粒体抗原 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸残基(FG)的联接充分利用反复基因序列。然而,IDR如何导致基因基因序列错误调节和愈演愈烈尚不清楚。
2021年6翌年23日,北弗吉尼亚的大学教堂山所学校 Gang Greg Wang 工作团队等 Nature 发表了篇名:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的科学研究论文。
该科学研究得出结论比方说是帕金森氏症逐步形成的转子因素,帕金森氏症通过比方说赢得凋亡以建立致癌器物酪氨酸遗传器物质孕育器物,这同时加强了它们的基因基因序列组抗病毒连续性并在再生更进一步中都诱导反常建模肝细胞构造的逐步形成。该科学研究是最早将比方说与帕金森氏症逐步形成联系起来的科学研究之一。因为在其他恶连续性中都掩蔽到了相似的基因基因序列联结,文章中都阐明的功能也可以解释其他各种类型的帕金森氏症。
NUP98–HOXA9包则有两个胺基酸基序和一个联结基因序列。为了科学研究NUP98-IDR在胃癌愈演愈烈中都的主导作用,科学研究工作团队主要使用掰除了联结基因序列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。
他们推断出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏相-比方说孕育微的有机器物)处理尖锐。转化的NUP98-IDR(N-IDR)抗原在微外逐步形成试管微孕育器物。
为了更进一步审核FG反复基因序列对孕育器物逐步形成的酸度依赖连续性和多价连续性的重要连续性,科学研究工作团队氢化了则有有有所不同数量FG反复基因序列的重组N-IDR胺基酸。他们推断出N-IDR包则有38个或36个FG以酸度依赖连续性的模式反复逐步形成的试管滴,那些包则有27个或11个FG的却不能进行比方说。断定NUP98–HOXA9中都的IDR以价依赖和酸度依赖的模式建立LLPS。
NUP98–HOXA9通过同源构造域与DNA联结,导致胃癌愈演愈烈更进一步中都的基因基因序列痉挛。紧接著,科学研究工作团队通过肝细胞免疫沉淀和高通量测序来审核IDR介导的比方说对NUP98–HOXA9肝细胞抗病毒连续性的因素。
结果显示, N-IDRWT/A9带有显着加强的基因基因序列组市场占有率,而与无督导聚类定义的瞬时亚类毫无关系。此外,长三而近的超强加强子样峰是N-IDRWT/A9所独创的,并且在发育期和胃癌涉及基因基因序列富集。
为了更进一步审核IDR诱导的LLPS在嵌合微肝细胞抗病毒中都的主导作用,他们借助于了免疫学和生器物化学的方法,得出结论IDR介导的LLPS在加强嵌合酪氨酸遗传器物质抗病毒连续性方面的缘起主导作用,相比之下超强加强子样峰处看到的那些。断定IDR加强联结微的基因基因序列组联结并且加强靶基因基因序列诱导。
为了测试NUP98–HOXA9通过LLPS逐步形成肝细胞重复的控制能力,科学研究工作团队分解了理解N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C研究成果,概述了DNA重复和复制错综复杂的持续性涉及连续性。
为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C接触频带的因素,他们有数了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9理解细胞中都500个最强烈的N-IDRWT/A9占据位点错综复杂的基本粒子总和。结果显示,N-IDRWT/A9重复以基本上与CTCF毫无关系的模式逐步形成,与比方说转子功能一致。另外,N-IDRWT/A9特异连续性重复继续直达加强子和靶基因基因序列错综复杂的直达,赞成了联结酪氨酸遗传器物质的IDR通过比方说在超强加强子样各种因素和肿瘤基因序列错综复杂诱导DNA重复的观点。
综上所述,该科学研究推断出NUP98–HOXA9中都则有有的LLPS活连续性IDR对胃癌的愈演愈烈和致癌器物基因基因序列理解程序来的诱导至关重要。这些效应由IDR的控制能力介导:1)加强酪氨酸遗传器物质与基因基因序列组各种因素的联结;2)有助于加强子和肿瘤基因序列启动子错综复杂的长距离重复。
该科学研究提供了一个致癌器物凋亡的原理连续性证据,该凋亡在再生更进一步中都有助于LLPS转子的酪氨酸遗传器物质联结和3D肝细胞重组。由于则有IDR的LLPS活连续性小分子与广泛的帕金森氏症有关,该科学研究阐明的功能也可以解释其他各种类型的帕金森氏症。
原始出处:
Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.
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